施肥這件事，友善環境小農各自的作法不同，有的小農要增加產量，會使用有機肥，有的小農會自己做液肥，稀釋後撒入田中；而也有小農是使用自然農法，完全不施肥，只靠休耕期種的綠肥作物，翻攪到田土中腐爛成肥份。小農種稻若要施肥，通常在插秧後三十天左右會進行追肥，這時植株正在分櫱，施肥可讓植株分櫱旺盛，增加產量，追肥肥份以磷肥比例高的肥料為主。而等到至稻子抽穗期時，會另外追加穗肥，讓稻穗結穗飽滿，穗肥肥份以鉀肥為主。