友善耕作不使用化學肥料，宜蘭稻作目前都是一年一獲，只做一期，另一期配合政府休耕政策，通常休耕也會種植綠肥作物，配合地主符合領取補助的資格。有些友善小農也只用綠肥作物翻耕後的肥份，不另外施肥。而有些友善小農，會在插秧前，增加土壤肥份，也會在田區施放基肥。基肥目的是讓秧苗在成長期有更好的肥份，有的小農會使用有機肥，有的小農會自己用農業廢棄物製作液肥，或是利用米糠當基肥。施肥時可以藉由曳引機進行細打翻田時，把肥料桶加掛在鐵牛機器上，邊翻土邊下肥，讓基肥在田區分解。