學甲慈濟宮主祀神明保生大帝，其信仰源自福建，乃中國大陸東南沿海一帶廣受崇拜的醫神。上白礁是由於過去交通不便無法返回中國的祖廟謁祖，因此選擇在將軍溪畔遙祭祖廟，稱為上白礁。「學甲刈香」是由「上白礁」繁衍而來，早期的「上白礁」僅係其轄域的一種神明祭慶，大抵在1981年前後，始變成今日全臺聞名的盛大廟會。
學甲慈濟宮大令為保生大帝統領兵馬的法器，由桃枝結上紅綾製成，又稱為鴨母令，相傳保生大帝曾經協助某地神明收服鴨母精，其手下鴨母兵全數納為保生大帝麾下，此後只要保生大帝出巡，就需要將此令取出，代表領兵出巡。
