學甲慈濟宮主祀神明保生大帝，其信仰源自福建，乃中國大陸東南沿海一帶廣受崇拜的醫神。上白礁是由於過去交通不便無法返回中國的祖廟謁祖，因此選擇在將軍溪畔遙祭祖廟，稱為上白礁。「學甲刈香」是由「上白礁」繁衍而來，早期的「上白礁」僅係其轄域的一種神明祭慶，大抵在1981年前後，始變成今日全臺聞名的盛大廟會。

謝府元帥，又稱為大使公、大使爺為學甲慈濟宮陪祀之神明，相傳也是於明鄭時期前來臺灣，歷史悠久。謝府元帥為東晉時期的軍事家謝玄，於淝水之戰以寡擊眾，打敗前秦大軍而聲名遠播。