本論文的目的，主要是希望藉由現生貝類的調查和碳氧同位素的分析，來探討有關澎湖地區史前貝類遺留的意義，以及古代水體環境的含意。根據研究材料分析結果顯示，澎湖地區考古遺址的分布密度與海洋底質及潮間帶範圍的大小關係密切。其次，史前聚落居民偏好採食鐘螺、蝾螺、九孔螺、蜑螺和蟹守螺等貝種，碳同位素值的分佈，反映出當時的海水環境，與現今相類似。但氧同位素值的判讀，呈現當時的水體溫度偏高。有關貝類生物相的改變，澎湖地區的案例應歸諸於海岸環境變遷的影響。