山水萬善廟又稱作周克順祠堂。興建年代不詳，據說本來是清朝時期位在今觀海別墅前的榕樹北側（舊山水漁港檢查哨）的一間有應公廟。民國49年（1960）因為年久失修，由陳傳位、黃進金及值年鄉老陳水能、鮑才教、陳海豬等人發起遷建，經北極殿恩主公降鸞指示廟址後，由里民籌款以石重建，於同年農曆7月初1日萬善爺聖誕時舉行落成慶典。

民國84年（1995）管理委員會又倡議重建，由旅台同鄉及信眾樂捐，經北極殿秦大千歲指示「重建依原地，字向不移，地基可稍偏東，增建尺寸由眾弟子自決」後，於同年的農曆11月10日奠基，改在原廟東側興建一座寬5.46公尺、深9.7公尺的新廟，於民國86年（1997）農曆7月2日落成。山水里萬善廟今貌內有供信眾問卜的靈籤，每年節慶也都有祭拜；早年由公廟的3個甲頭值年老大，輪流負責每天早晚的祭祀（每人輪值一個月），近年來才改由山水北極殿的廟公負責燒香。

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林文鎮（2007）.馬公市各里叢書（寺廟篇）