基隆市「家畜疾病防治所」，創設於1966年（民國55年）9月19日，地點在七堵區。

　　家畜防疫工作，比增產設施更為重要，如此才能保障原有畜產事業、避免損失，進而帶動農村經濟。戰後，基隆市政府除經常加強防疫業務，徹底施行定期防疫注射，交換傳染病發生情報外，並加緊計畫辦理、設置各種「家畜示範村」。而後，為求防疫工作有更顯著效果，才特別設置「家畜疾病防治所」。

　　基隆市「家畜疾病防治所」的前身，為市政府建設局1957年（民國46年）成立的「家畜防疫隊」，當時僱用臨時家畜防疫員3人，辦理豬瘟預防注射工作。

　　依據〈家畜疾病防治所組織規程〉，基隆市「家畜疾病防治所」應置所長1人，技士1人，技佐1人，辦事員1人。然而編制職等太低，薪資不高，大學畢業的獸醫人員不願屈就，一般職校畢業的人，又不具資格。因此，所長一職，當時僅只派市政府農林課資深職員兼任，由於無專長專職，故在工作更無顯著表現。

　　基隆市「家畜疾病防治所」的工作，主要是應對豬瘟、豬肺疫、豬丹毒、牛蘇拉病、雞瘟等危害畜牧事業的傳染病，透過病材處理、細菌檢查、抽血檢查等過程，完成預防措施。

　　基隆市「家畜疾病防治所」，於2000年（民國89年）被裁撤，動物保護、動物防疫、畜產管理、獸醫行政管理相關業務，併入建設局農林行政課，並由2名獸醫辦理。

　　2014年（民國103年），市政府有鑑於臺灣禽流感、口蹄疫、狂犬病等重大疫情不斷爆發，有新興人畜共通傳染病的潛在威脅；因此成立「基隆市動物保護防疫所」，延續「家畜疾病防治所」的任務。地點在信義區信二路。

　　而在七堵區有一服務據點，名為「寵物銀行」（動物收容所），位在大華三路45-12號，可能為基隆市「家畜疾病防治所」的原址。