「基隆市水肥處理委員會」，於1953年（民國42年）設置。其成立緣由，乃中華民國政府鑒於全臺各都市人口劇增、水肥增產，為整理環境衛生、增進人民健康，並充分利用供作農漁之需，乃通令各縣市組織水肥處理委員會，而成為專設機構。

　　其業務有：水肥清運、農肥供應、水肥外銷、預防「霍亂傳染實施疫區駛來船隻」其糞便消毒與清運、公廁清掃消毒等。

　　基隆市的水肥處理機構，在日治時期由市役所庶務課並管。1931年（昭和6年），庶務課設清掃監督，然後擴充為衛生系。1935年（昭和10年），市役所衛生系復劃出，改設衛生課，並專設清潔系，辦理其事。至1943年（昭和18年），實際工作機構為市役所轄屬的「衛生站所」。

　　戰後，水肥處理工作由警察局、衛生局分別負責辦理。1946年（民國35年）1月市警察局成立衛生隊，負責處理水肥、垃圾。

　　「基隆市水肥處理委員會」於1953年（民國42年）成立時，由當時市長兼主任委員，市警察局長、衛生院長、民政局長、建設局長、財政科長、市農、漁會理事長等為委員，決定水肥處理業務內容、水肥售價、水肥收益用途的核定等事項。

　　主任委員下設總幹事1人，承主任委員之命，處理會務；並設總務、業務2組，置幹事7人。雇員3人，以幹事2人兼任組長。工人部分，除司機、技工、木工、清除領班、跟車、倒車、勤工、廚伕外，其餘均為清肥工人。

　　截至1966年（民國55年），清運工具計有水肥車、天馬牌真空幫浦5部（已使用12年）、道奇牌真空幫浦2部（已使用20年）、奇姆西牌真空幫浦2部（已使用15年以上）、裕隆牌真空幫浦2部，拖車10部等。

　　「基隆市水肥處理委員會」，於1972年（民國61年）4月1日，與基隆市衛生局清潔隊（先前由警察局衛生局改隸）合併，改編為基隆市清潔管理所，為基隆市水肥處理、垃圾清運、水溝疏浚、公廁清掃消毒的專責機構。