財團法人自由思想學術基金會成立以來，即長期推動台灣自由、民主及人權的理念，編輯出版前人自由民主的論述，並追求轉型正義的落實。而在來自中國大陸的自由主義者部分，雷震的相關著作及《自由中國》相關文獻的整理出版，是基金會編輯出版的重點之一。 雷震由於批判強人威權體制，主張在台灣落實自由民主改革，反對蔣介石總統三連任，並和台灣本土精英籌組中國民主黨，而於1960年以莫須有之罪名，下獄十年。失去自由期間，雷震曾撰寫回憶錄，為自己留下歷史紀錄。但是雷震出獄時，回憶錄文稿先遭沒收。1980年代末期台灣政治漸趨緩和，雷震家屬也積極追討回憶錄。而在監察院介入後，由於相關負責人仍存有黨國思想，遂違法加以銷毀。 不過，雷震在回憶錄被扣之後，深感對於過去歷史的紀錄，相當重要，特別是他在中華民國制憲之時，扮演朝野折衝的關鍵角色，其回憶和解釋是認識中華民國制憲過程及憲政理念的參考文獻，過去本基金會也完成制憲史三冊的出版。

另一方面，雷震對國民黨當局對他的打壓與構陷也十分在意，認為有必要根據事實回應。其中國民黨當局由軍中發起的「向毒素思想總攻擊」。再由黨政軍團對《自由中國》展開圍剿，是雷震最在意的問題之ㄧ；另外，則是國民黨當局逮捕雷震之後，對外發表（其後又迅速回收）的「『自由中國』半月刊違法言論摘要」。雷震在恢復自由後，針對國民黨當局的指控，先提出指控內容，而後再一一根據當持的狀況、文章的內容，逐一反駁，替自己爭自由民主的作為，尋求歷史的平反與定位。在某種意義上，透過當事人提出的證據，與國民黨當局的指控對話，藉以釐清歷史真相，這也是轉型正益相當重要的一環。因此，本基金會決定投入人力，從手稿中爬梳、出版《雷震的歷史辯駁》。