約日明治38年（1905）間，曾古井（約1885-1941）從哥哥經營的中藥鋪習得一技之長，在臺南水仙宮旁南勢港水道盡頭的商店街落腳，自立門戶，取名萃芳園，但後來大家都稱之為古井藥房，至今已傳承三代，成為臺南府城現存最久的漢藥店之一。
古井藥房坐落在今民權路三段水仙宮市場旁，曾經車水馬龍、戶限為穿，如今則門可羅雀。第三代曾士杰（1950年生）不忍心見祖父和父親的心血就此斷送，咬牙苦撐。
店裡的藥櫃、錫製及瓷製各式藥罐、黃銅藥杵，都是祖父傳下來的，古樸耐用，至今仍完整保存。
曾古井創設萃芳園藥房時，店後就是港口，藥材由南郊從廈門買進，在此卸貨，佔地利之便。店門口則朝向進出府城的要道—宮後街，靠往來人潮奠下經營基礎。之後日治時代市區改正，店門口才轉向新闢的民權路三段（本町）。曾古井事業有成，在街上替8個兒子各配1棟房，也因此藥房雖然在民權路上搬過幾次，但也不過就是倉庫換成店面，店面換成倉庫而已，都是曾家房產。
曾古井因病早逝，其子曾焜燿（1919-2000）22歲便克紹箕裘，承擔家計，也幫習醫的哥哥負擔學費。因為客人習慣用曾古井的名字稱呼藥房，曾焜燿便把招牌改為「古井」（營業登記仍為萃芳園藥房），挺過二戰空襲的磨難，撐過戰後初期的混亂，傳承至今。
當年不到10坪大的藥房，上下午各有1名中醫師駐診，客人絡繹不絕；傳承至今，古井已為府城現存最久的漢藥店之一，各式藥罐古色古香。五香粉為臺南多家肉包店採用，四珍膠亦為知名產品。