對友善耕作的小農來說，尋求各種更有效率，對環境也友善的做法。有的小農並不施肥，完全靠把植株翻耕入田區腐爛創造的肥份，來種植下一期的茭白筍。但若是有規模商業型態的生產，這時候就會考慮使用有機肥。種植期間的肥，中段重鉀肥，有助於植株粗壯，利於成長與育筍。後期的肥是希望分蘗的新苗能順利成長，趕上收割末期。如未施肥，收割期最後的筍都會纖細瘦小。有機肥料的成分來源多是黃豆粕、麥粕、米糠、蓖麻粕、骨粉、棕梠灰、泥炭，時效雖較化學肥料慢，但只需要一個禮拜就能反映在植株上，且效果也較化肥長。施用時可以選擇沿著走道沿途施放，或在各個植株旁撒放一把有機肥。施肥後須注意須暫停進出水三到五天，避免肥份流失。