2009年林務局羅東林區管理處，將員山管理森林資源的工作站轉型，規劃具在地林業與保育特色的員山森林生態館。同年，委託財團法人人禾環境倫理發展基金會參與館舍經營，進行遊客服務與各式教育推廣課程規劃與執行。課程採分眾分齡的環境教育，來探討環境與生態保育議題，以「團體導覽」、「季節特展」、「館舍小活動」、「戶外教學及到校推廣」、「主題活動」及培力成人增能的「專業研習」，提供親子共學與遊客教育推廣服務。豐富的課程支持下，場域在2015年3月16日獲得環保署「環境教育設施場所」認證，成為學校團體與社會大眾，認識森林生態及生物多樣性的環境學習中心。

2011年林務局為了管轄全台8處生態館，進一步發揮各館「宣導生態資訊、落實保育行動」宗旨，2011-2012年借重人禾基金會辦理員山森林生態館的環境教育專業，委託執行「林務局生態教育館推動輔導計畫」，由郭育任教授擔任計畫主持人，訂定生態教育館整體發展策略，引導各館館務發展，推動更名，分三目標:擬定各教育館中程發展策略，落實館舍功能並強化人員專業知能，提供保育教育服務及促進大眾對林務局保育工作的認識與支持。

結合展示與學習場域的打造，並透過教育活動來推廣，是活化館舍並傳遞知識的重要方式。1997年到2009年，以林業經營與保育專業為主的林務局，在全台陸續成立森林生態館來做為保育資訊、研究監測及培力據點。由員山森林生態館，更名為員山生態教育館，足見林業事務推動發展的重點，逐步由山林專業的經營，走向面對群眾，進行第一線生態知識的傳遞工作。

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