蘇厝長興宮主祀玉敕代天巡狩十二瘟王，是一座典型的瘟王廟，奉祀張、余、侯、耿、吳、何、薛、封、趙、譚、盧、羅十二府千歲爺。蘇厝長興宮的瘟王祭為七朝王醮，每逢丑、辰、未、戌年舉行，祭典儀式中遵循傳統禮儀，深具在地特色，體現了蘇厝王爺信仰與地方的交融關係。
王醮之前擇日搭設衙門，衙門為千歲爺巡狩駐驆的行臺，衙門周圍以紅色欄杆圍起，除了正門之外，左右兩邊各設立東西轅門以供道士與轅門官進出，前方設置鼓吹亭與炮亭，在轅門官或道士參謁時演奏音樂並燃炮。衙門外更立有兩支紅色旗桿，升起帥旗，以凸顯千歲爺之威嚴。
