康熙37年(1698)郁永河《裨海紀遊》出現小門嶼而無丁字門，也就是17世紀末小門嶼知名已逐漸取代丁字門的說法。乾隆8年（1743）《澎湖志略》一書，胡格提及：小門並橫礁至媽宮水程三十里 小門汛，砲臺一、烟墩二。小門汛雖為國防上防守的重點，然而從澎湖輿圖觀之，汛塘戍防所在位置為竹篙灣而非小門，故而竹篙灣留有多處烟墩的地名。
乾隆34年（1769）《澎湖紀略》西嶼澳中並無小門社，蔣鏞的《澎湖續編》(1832)一書中亦全無小門一語。故而，小門在18世紀中期，當時人上西若非尚無人居，就是人煙稀少附屬於竹篙灣而未被認定為獨立的「社」。蔡光庭對小門姓氏的研究，推算小門最早遷入的姓氏也在乾隆朝之後，大致與方志上的記載吻合。直至清末，林豪於光緒19年(1893)的《澎湖廳志》書中，始將小門社列入西嶼澳。