其次，依據台灣總督府公文類纂明治44年15年保存第73卷＜東吉嶼及六尺礁燈臺位置調查復命書 ＞內容顯示，此報告書完成於1911年6月26日，之所以選擇六尺礁建立燈臺，肇因於此地船難頻繁，例如清光緒年間，有艘汽船搭載兵士千餘名，誤觸六尺礁而沉沒，溺死者八百餘名，為確保澎湖水道安全，乃有六尺礁燈臺之計劃。，田上鄉吉與尾原菊三認為：六尺礁於低潮時才露出六尺左右之礁岩，面積狹小，建設燈臺屬水中工事，工程費需貳拾萬圓以上，若於面積較大，施工相對較易地查母嶼建設燈臺不僅可明示六尺礁、引導此航道光明。最後，總督府乃捨棄六尺礁，選定查母嶼興建燈臺。