新城事件發生後，為了紀念殉難的軍警人員，日本政府於大正3年(1914)建造木造納骨堂，大正9年(1920)又設立「殉難將士瘞骨碑」；後於昭和12年(1937）在舊址西南側(今聖母園)以鋼筋混泥土材質建造神社。
新城天主堂目前仍保持昔日神社神域空間，本殿舊址四周高聳優美近百年樹齡的日本黑松，搭配懷舊的神社遺址與莊嚴的天主堂，顯得古樸、讓人興起思古幽情，位於禮拜堂前花圃內，仍可見一塊寫有「殉難將士瘞骨碑」字樣的大理石，在石碑背面隱約可見當時殉難之日軍罹難者的名字。