位於成功鎮新港漁港旁的「成功萬善廟」，除主祀萬善爺外，還祭祀著一尊木製旗魚神，為全臺唯一祭拜旗魚神的廟宇。早期的萬善廟，僅為一間鐵皮小屋，供奉一座境內無祀男女善緣等眾之神主碑。民國45年（1956）地方仕紳李益義，自臺南南鯤鯓萬善堂請分身來此設萬善爺廟，供居民祭拜。當時的分身僅為一塊石頭，直到民國68年（1979）廟婆何張邱霞的先生何萬清，受萬善爺公指示塑金身。民國77年（1988）建廟落成，民國89年（2000）因漁獲不佳，漁民祈求保佑，萬善爺指示製作旗魚神供膜拜祭祀，因此萬善廟又稱為「旗魚神廟」。