新的關山站建於民國69年（1980）。舊關山車站興建於日治大正11年（1922），當時稱為里壠驛，昭和12年（1937）改稱關山驛，里壠到臺東間41.9公里的鐵路是收購自臺東拓殖會社。而因新的關山站自民國69年（1980）開始啟用，經過大約三十年左右，交通部在民國100年（2011）年左右開始規劃重修車站，而關山車站為交通部鐵路改建工程局推動「花東新車站運動」計畫時，第一座改建車站，於民國100年（2011）11月18日動工。隔2年完成啟用，車站等級為三等站。新改建之關山車站與舊站之間仍保留舊時氛圍的元素，並在新、舊車站之間設置步行空間，連結並延伸至舊站宿舍群，營造東拓鐵路綠廊意象，導引人們走訪東拓鐵道重塑歷史文化軸線。