石寧埔公學校創立於大正6年（1917年）4月，設立於東海岸道路的西側較高之河階上，主要提供當地阿美族與少數漢人學童就讀。早年設立於沙汝灣（今宜灣），大正13年（1924年）4月將校址移至石寧埔，改稱為石寧埔公學校，昭和16年（1941年）根據日臺共學政策「國民教育令」，更名為石寧埔國民學校；戰後改稱寧埔國民學校，民國57年（1968年）實施九年國教後，再次更名為寧埔國民小學至今。由於東海岸阿美族個性較為溫和，因此未被劃入蕃地，而是以一般平地公學校作為教育機構，有別於日本人念的小學校與原住民的蕃童教育所。