國民政府來臺後，旗後山長期被劃設在軍事管制區的範圍，90年代開放前，由海軍陸戰隊守備營駐守，屬於岸防砲營地。因此本處除了日遺軍事設施，國軍於旗後礮臺及高雄燈塔間通道，亦增設碉堡和營舍，包含山腳碉堡、隧道等處哨點，皆派駐人員駐守。
1988年，國軍與市府、民意代表曾就旗後山等軍事空間開放事宜進行協調，後亦因軍隊精實而撤離，旗後山部分設施及用地拆除後交接予高雄市政府，1992年、1995年陸續開放高雄燈塔及旗後礮臺供一般民眾參觀。
燈塔與礮臺間興築得水泥碉堡，含兵舍營房、砲陣地及彈藥庫等設施，門口設有避彈牆，另有中型坑道，分為地下三層，第二層空間為寢室，最下層則推測置有90防空火砲及多個機槍射口，面朝高雄港第一港口。其他地面設施如警衛班房舍與軍用水塔，目前僅剩地基與遺構閒置。
