銅門祠位於花蓮港廳花蓮郡蕃地同門社。銅門祠於昭和11年(1936)6月27日鎮座，社格為社，祭神為開拓三神、北白川宮能久親王，例祭日為每年的6月27日，並在神苑內建有一座紀念高砂義勇隊之忠魂碑，於昭和18年(1943)12月19日上午舉行揭幕式。
戰後，這座神社仍保持的相當完整，民國40年(1951)花蓮發生大地震，當時神社也遭受到嚴重的毀損，當時神社拜殿屋頂瓦片及柱子也皆有位移甚至瓦片掉落之情形，民國89年(1990)銅門地區發生嚴重土石流，銅門村12、13鄰慘遭淹沒，當時銅門神社也在這次事件中遭淹沒。目前原址現已成為攔砂壩，不過仍保留一座遭推倒之忠魂碑於原紀念碑基座後方，另外兩座石燈籠中段竿從神社原址沖至下游，被當地居民發現，並撿回做安置。