大正2年(1913)總督府殖產局於鳳林鎮設立第三座官營移民村-林田村，並在大正4年(1915)建立林田神社，大正4年(1915)6月6日鎮座，社格為無格社，祭神為開拓三神(大國魂命、大己貴命、少彥名命)、北白川宮能久親王，例祭日原為每年的6月6日，但因這時期正好遇到了農忙期間，加上天氣酷熱恐怕有衛生上的疑慮，故自昭和3年(1928)起改為每年的10月6日舉行。
戰後，神社奉命改為鳳林區忠烈祠，每到三月二十九日，鳳林各級學校學生都會在師長的帶領之下到此參拜，民國61年(1972)日本宣布與中華民國政府斷交，民國63年(1974)當時的國民黨政府宣布一旨《清除臺灣日據時代表現日本帝國主義優越感之殖民統治紀念遺跡要點》，故在同一時期，地方人士便向附近的小學借了拔河繩，將戰後改建的忠烈祠本殿拉倒至本殿後方，而當時鳳林鎮公所有意在鳳林水源地設置新忠烈祠，並以神社所在興建運動場，於是林田神社鳥居、石燈籠等設施皆遭推倒至參拜道北側檳榔園。民國97年(2008)一群熱愛古蹟之志工共們發起打掃活動，才讓神社本殿及遭雜草淹沒之神社遺物重見天日，後在經歷民國100年(2011)6月、8月，由鳳林鎮公所委託隆成工程顧問有限公司於鳳林鎮圖書館舉辦兩次「鳳林鎮大榮二村林田神社遺址風華再現規劃」會議，更在上級單位的挹注之下，讓林田神社重回昔日風華，今除在外苑將兩座鳥居及數對石燈籠重建外，內苑之玉垣、本殿及基壇仍保留當時之樣貌，如今也成為林田移民村相當重要的宗教歷史現場。