富里國小前身為明治34年(1901)設立的臺東國語傳習所公埔分教場，明治38年(1905)改「公埔公學校」，昭和12年(1937)再改稱富里公學校，昭和16年(1941)改為富里南國民學校，學校之東北側曾建有一座校內神社(大麻奉齋殿)，當時為了紀念日本慶祝皇記二千六百年祝典而興建，興建時間及祭神目前皆無記載，不過可推測應該在昭和14年(1939)左右。
民國101年(2002)由富里鄉公所出版的《富里鄉誌下卷-富里影像誌》中有收錄兩張富里公學校校內神社之舊照片，由老照片中可見當時的校內神社配置相當的簡單，設有神明鳥居一座、石燈籠一對及一座超過2公尺高的本殿基壇及神明造本殿。
戰後，隨著數次校舍改建及規劃，校內神社位置已成為學校東北角游泳池及擋土牆一角，已不見一絲遺跡。