2014年8月21日全國教師工會總聯合會（下稱全教總）發文， 質疑教育部自2006年起持續以龐大之經費試辦教師專業發展評鑑，卻僅以補助要點的方式持續編列經費，甚不合理。 該文中同時針對教師專業發展評鑑歷年辦理之諸多弊端，提出意見：包括各校或縣市諮詢顧問，卻又同時擔任教育部部初審及複審委員，有球員當裁判之情事；辦理教師專業發展評鑑納入高中職學校評鑑審核指標；私立學校，以考核考績或續不續聘等手段，強迫學校教師全部「自願」參與等。 另外還有教育部擬成立校長及教師專業發展辦公室及發展中心，以及有關於若教師於評鑑之後，如發現有需改進之處，多數學校的實施計畫對此付之闕如等。 不宜再增設。綜上，。 教育部於2014年9月10日覆文，覆文內容主要提供自95年起的參與數據表，表示先進國家均透過教學觀察、教學檔案、專業社群提升教師專業能力， 並認為已獲致多項成果包括評鑑方式、促進專業對話、逐步建立評鑑與輔導培訓認證制度、建置輔導網絡與專業成長支持系等。 但對於全教總日前所提出建議及詢問，以及主張應暫停審議「辦理教師專業發展評鑑實施要點」，並要求召開檢討會議再評估是否持續投入經費，均未正面答覆。