中華民國全國教師會（簡稱全教會）依據台北市政府教育局（以下簡稱北市教局）2008年5月12日北市教中字第09734248000號函，於同20日以九七全教教字第九七二三九號函發文教育部教研會、中部辦公室、國教司、試辦教師專業發展評鑑推動小組。主旨為全教會對於北市教局以「行政程序不合規定為藉口，試圖掩飾該局嚴重違反言論自由」，並將責任推諉予下屬學校之行徑，感到無法苟同；對於教育部至今未能明確查處及面對北市教局推動「試辦教師專業發展評鑑計畫」的重大缺失，感到失望與遺憾。說明大略為，萬芳高中於2008年4月30日下午同時安排兩場研習，提供教師依其研習需求選擇。在教育局人員電話中表示「對講師人選有意見」、「立場不同」，萬芳高中僅取消邀請全教會幹部擔任講師演講有關教師評鑑之研習。北市教局12日函以作息安排未依該局規定報局核准，不予備查，則應該要求兩場研習都予停辦，顯見以不同標準對待該兩場研習，排斥教師會參與教師評鑑議題的討論。且在演講即將開始，硬生生要求講師取消演講。對此次違反言論自由之決策的傲慢與輕忽，全教會重申，在北市教局此次之行徑被糾正，並確實改正之前，台北市已不適合再向教育部申請試辦教師專業發展評鑑計畫。