全國教師會於2006年12月27日發出新聞稿【北北基及中部部分縣市自辦基測、統一教科書版本─犧牲學生入學選擇權、增加學生考試壓力、政治干預教育專業】指出台北市教育局於2006年12月21日召集北北基三縣市教育局、家長會、教師會研商後，報載會中對「一綱一本、共辦基測」有共識，並非實情，各方仍多有疑慮。 全教會主張，在選擇教科書和入學考試的制度上，應該站在「教育專業」的角度上，以維護學生「入學選擇權」和「受教權」為最高考量之原則：一、不應犧牲學生入學選擇權、增加學生考試壓力；二、政治不應干預教育專業，妨礙學生受教權；三、中央與地方都應主動溝通，不應在媒體上互相放話。 同時更指出不論孰是孰非，政府機關之間對同一政策有不同之作法，應主動互相溝通，不宜在媒體上互相放話，使師生家長無所適從、干擾學校正常教學，雙方實在都有虧職守。