郭家古厝位於五甲巷旁，屬於七開間的三合院式，因為帶兩開間建造左右伸手，所以形成進身比較淺的扁平內埕中庭，庭院內的地面鋪有符合傳統的萬字紅磚，屋頂材質選擇有避風作用的柳條磚。正身設計有三個門供家人進出使用，古厝內部有充足的內部廊道系統(子孫巷)，而和一般古厝較為不同且比較少見的是，郭家古厝的後院沒有留設通路。
古厝的外牆，雖然看起來是紅磚建造的，但是在當年能以紅磚建造的屋舍其實不多，大多都是土角厝。古厝內還有設置因應二戰當時頻繁的空襲，僅供自家人使用的防空洞。原先在庭院內設有三個，現在因為整修內部，重新鋪設地面紅磚而填平了兩個，僅留下一個最小的防空洞提供參觀遊客見證當時的烽火年代。正身門楣上提有「梅魁」這異於漢人的堂號，根據推測，可能是當時的平埔族將女兒嫁給對當地有幫助的駐兵將領，或將領感念母親恩德等可能性。