放眼望去，會看到郭家古厝中最搶眼的部分，馬背。馬背又被稱為馬歸、五行山牆或是馬鞍牆，是華南地區、漢族傳統建築中常見的屋頂曲脊和垂脊銜接形式，馬背是由曲脊、紋路和脊頭所組成，內部有磚瓦，馬背的大小會依照正脊和屋身的尺寸而做變化，使用馬背的建築物特色是屋脊中間平直，屋簷兩旁收於牆邊。
在左營舊城的古厝聚落中，可以觀察到不同家族所使用的各種不同造型的馬背。因為早期臺灣的人民對於五行觀念相當相信，所以在蓋房舍時也會將五行風水考慮進去，以致馬背的形式：金形圓、木形直、水形曲、火形銳、土形方，也會因著屋主的職業適合度而改變。
郭家百年古厝的馬背屬於木形馬背，屋主在修復的時候特別進口日本的専門漆，請老師傅重新繪製，希望重現當初馬背的原貌。