日軍動員了1萬餘人探測太魯閣山，根據其地形以擬定作戰計畫，這一次是大規模的軍事行動，配合軍事需要開道路、架電線、設醫院、築軍營及儲備物資，榨取臺灣同胞身上的脂膏，還要征用他們的血，以染污太魯閣，更想把太魯閣作為大和民族的屠宰場，用山胞們的血點綴天皇的皇冠，博得天皇的御賜。民國3年5月31日一切就緒，佐久間總督召集各路統帥的將領，宣布成立征討太魯閣總司令部，以下是他的繳文：臺灣歸日本版圖已將20年，西部治安雖無不如意，東部則因太魯閣與諸番，諸事業進行大受阻礙，為是鞠師陣旅，會同警察陸軍，維揚我武，緩陣數策，尚希遵行。諸番冥頑不靈，討罰之計：收押其槍器彈藥，革去陋習，使沐我皇恩，毋為過甚之行。軍事進行務求神速，恐生意外之變，倘逢諸番故意遷延，有企圖者，務速行剿擊。軍警入山，宜先立不敗之地，以逸待勞，彼雖捷將無所用。