高雄捷運生態園區站，車站的地名原來叫做菜公，共有兩個出入口。由於位於博愛公園與原生植物園附近，所以原來叫做植物園站。但是因為車站位於左營著名觀光景點蓮池潭、洲仔濕地、原生植物園、半屏山等多個具生態特色風景區的起點，因此後來定名為生態園區站，讓遊客乘坐高雄捷運來到這個車站，就能因為站名而聯想到周圍充滿生態與綠意的自然資源，進而駐足停留，前往這些生態風景區遊憩。
高雄市政府希望觀光客來到高雄之後，除了可以愜意的在漢神巨蛋等流行商圈消費，或是享受知名夜市的美食之外，還可以有不同的選擇，或親近大自然，享受芬多精的生態體驗，或在這些生態景區裡吸收保育和自然科學知識，認識臺灣原生的動植物與地形等，體現自然科學與生態教育的理念。