台大校長楊泮池於2017年3月18日以維護台大信譽為由，宣佈不續任台大校長，但在聲明中表示「單純的學術倫理事件，演變至今已變成不顧事實、隨意指控、無限上綱的情形，對於事件中顯現『好惡等同是非』，信口開河，少數人操縱媒體現象，深不以為然。」全國教師工會總聯合會（簡稱全教總）對此表達意見如下：
一、楊泮池不管是請辭或不續任，應該都為論文造假案負責，但聲明卻指外界「不顧事實、隨意指控、少數人操弄媒體」，彷彿他被霸凌而下台。事實上，楊泮池不以高道德標準自我要求，沒有做為最高學府校長的格調與胸懷。
二、楊泮池選擇不續任而非辭職，這是最不負責的下台方式。最近各種爆料接二連三出現，不續任似乎企圖平息爭議，但在任一天，仍可運用職權及影響力來遮掩外界質疑之事，不僅無法讓社會重拾對台大和學術圈的信任，也不會對楊泮池的不續任舉動表示肯定。
三、許多台大教師一向以社會良心自居，對教育、社會議題關心者大有人在，但本次卻少有台大的教師要求楊泮池下台負責，實在令人遺憾。
四、教育部、科技部對於論文造假案，和楊泮池的責任繼續和稀泥，讓台灣學術圈繼續成為學閥的囊中物，那才是台灣高等教育的大災難。