台大郭明良研究團隊有11篇論文造假，掛名4篇造假論文共同作者的台大校長楊泮池，無視校內外的批評，只以無校內法源依據的特別委員會進行調查，而楊泮池本人未停職或辭職迴避，全國教師工會總聯合會（簡稱全教總）與臺大工會認為，相關人員並未善盡所有應負之責任，楊泮池應該停職接受調查，科技部也應該主動依職權處理造假涉入的研究人員。
2016年12月14日媒體報導，論文造假事情的其中一名重要關係人郭明良，可能有長期收賄讓其他台大教授或醫師掛名論文的嫌疑。楊泮池校長涉及掛名造假論文，現在醫院內又爆出買論文風波。楊泮池面對國際學術醜聞，卻只有道歉、開設倫理教育課程、交由特別委員會調查。反觀前教育部長蔣偉寧，在事發後四天辭職，楊顯然仍在逃避究責。全教總表示有關研究人員學術倫理規範，科技部不能默不作聲，依據《科學月刊》報導，目前已經有超過50篇論文有作假嫌疑，重創台灣學術的國際聲譽，光是校長道歉與接受調查不能解決問題，科技部應該主動依照職權介入處理。為維護台灣高教品質，全教總、台大工會在當時建議，楊泮池校長應該暫時停職接受調查；科技部應該主動介入調查所有作假嫌疑之論文，並且進一步修訂學術倫理規範。