2013年4月1日媒體報導，台北、新北市私立中學大肆辦理「小六基測」，並懷疑這是入學測驗，補習班也因應競開「私校班」。全國教師工會總聯合會（簡稱全教總）表示，依「國民教育法」，私立中學國中部不可以用測驗成績挑選學生，使依私校法，也只有極少數學校可以，認為私中小六基測，家長疑慮不參加便失去入學機會。十二年國教後，因為教育部要給私校高中部很高的「直升比率」(5成到6成)，提供一般免試入學的比率反而不高，家庭經濟好的學生搶著進私立國中，私中國中部不願意收弱勢，成績需要加強的學生，及開設身心障礙學生的特教班，更有「傳聞中」的不合國家課程綱要的升學輔導方式。公立國中對於學區內的弱勢學生沒有拒絕的權利，課程及升學輔導必需完全遵守政府規定，因為公立國中是「公共化」的產物，私校在法律上稱為「公益法人」，不可以拒絕和公校共同負擔教育的責任。因此數度要求教育部宜儘速規劃整體方案，透過財務、課程、入學等機制，提昇「私校公共化」的性質，務使其成為十二年國教之助力，而非阻力。教育部至今對私校的公共化無有效策略，以致有如此多的私校明目張膽辦理小六基測，仍應儘速於法制及行政作為上提出有效對策。