「齊一公私立高中職學費」是今(2010)年3月2日教育部由政務次長林聰明向媒體告知， 8月入學之公私立高一新生學費齊一，隔天吳清基部長還拿自製的小看版，再次強調高一全面實施，甚至連辦理經費，將先行由相關預算挪支都說出口，政策勢在必行，全國各私立高中職也將此政策，做為入學宣傳時最重要的內容。歷經3個月，期間已有上萬國三學生依免試入學辦法選定各公私立學校，如今（6月7日）卻政策跳票，對這些學生就學權益及家長學費負擔，立即產生重大影響，學生失去的第一次基測權益，及已改變學習節奏近3個月的時間，不是教育部開放學生考二次基測這種小技術可以處理的。全國教師會要求對今年高一免試入學的學生應秉持信賴保護原則，學費補助不能設定門檻。教育經費如果能如馬英九總統競選政見年增240億，則各項齊一公私的作法有很大合理性，但中央教育經費明年不增反減至少一百億，應該一次攤開所有可能受到衝擊的項目及金額，不要今天爆學費補助縮水，明天爆頂尖大學經費稀釋。全教會表示在三天之內，政府如果沒有對本案妥善處理，不排除聯合各地親師生進行大規模的陳情與抗議。