依據2019年連江縣政府委託案《連江縣縣定古蹟「芹壁天后宮」修復及再利用調查研究成果報告書》，閩東廟宇形式除了封火山牆加仿牌樓式大門立面，其祠廟建築尚有歇山式屋頂加上屋角「翹飛椽」的形式。芹壁天后宮的木構造神龕為清代所造，「廟中廟」的神龕形式為閩東廟宇的傳統，亦即本案玉誥天龕神位上方的屋頂形式，可觀察到原鄉建「翹飛椽」的祠廟屋頂形式。然而，清代神龕原貌木構造為整座，現神龕下部已改為砌磚基座，可能木作因以往受潮或蟲蟻破壞，於工兵部隊改建時使用白色面磚並點綴有當時常用之拼花磚，表現當時工兵修建時期之特色。