傳統式的菇舍僅具有遮蔽功能和簡易加濕設備，並沒有環境控制的設備，因此農民均仰賴天候來生產，正所謂靠天吃飯。也因此過去這樣設施的菇舍多半是設置在氣候適宜的地區。臺灣以傳統式菇舍栽種的菇種大致上有香菇、木耳、猴頭菇、靈芝、洋菇和草菇，若不是尋找氣候適合的地區去興建，就是只有在適合的氣候才種植，例如以傳統式菇舍栽種的洋菇，就只有在秋冬季時進行栽植。雖然現在開始有人以鋼構鐵皮的方式建造，但大多數建造傳統菇舍多仍以竹、木搭建，上面再覆蓋帆布、不織布等簡易防雨隔熱材質，雖然造價便宜，但缺點是颱風季節容易被掀開或吹垮，其次出菇空間與外界也無法有效隔離，難以防範病蟲害入侵，且受限於天候因素，產量和品質無法有效掌控，正因為這些因素，傳統菇舍面臨了存續的很大挑戰。農業局表示，菇類栽培場以建材區分，有傳統利用竹木搭建，也有利用新型建材搭建者，以搭建之時間點區分，又有新建置和既有菇類栽培場等不同型態，其管理較為複雜，加上政府的建管單位稽查時，易誤判成違章建物，常造成菇農之困擾，現在傳統菇舍已逐漸在鄉村中消失。