在淨心堂內，經由不同的神父、神職人員帶領，會於平日定時舉辦彌撒，地點就在二樓的聖堂。彌撒又稱為感恩祭，是教會中的祭祀儀式，「彌撒」二字為拉丁原文的「missa」是由彌撒禮儀中的最後一句話：「Item missa est」而來，意指「儀式結束，你們離開吧。」進行彌撒禮儀時，又區分不同的流程，從主祭者、輔祭者進禮堂，全體站立詠唱後，接著是聖道禮儀，必須宣讀聖經、福音、講道、祈禱等等，之後才是聖祭禮儀、成聖體聖血，會以象徵耶穌血與肉的酒餅，期待耶穌再臨。彌撒是以不血腥的方式達成與耶穌受難時相同的奉獻，據天主教會在特倫托大公會議中提到，耶穌在最後的晚餐時建立了彌撒，並以葡萄酒、麵包替代他的身軀，要求使徒以此奉獻給天主，也以此儀式來紀念耶穌。