檢驗中心接收檢驗樣品後，由樣品管理員將樣品存放在冷凍櫃中，冷凍櫃溫度保持在4℃以下，每工作日檢查溫度一次，以避免樣品在完成檢驗前變質或損壞。

檢驗樣品的儲存、取用、廢棄及歸還，皆需依檢驗中心樣品接收管制作業程序書辦理，並記錄於「樣品儲存紀錄表」中。檢驗人員取用檢驗樣品時，依欲檢驗項目酌取用量，剩餘樣品依原儲放方式迅速歸位，並填寫「樣品取用紀錄表」。

檢驗中心利用收納箱的顏色進行樣品種類區分，強化樣品管理員對於檢驗樣品的管理。