澎湖水族館位於白沙鄉岐頭村濱海區域，為澎湖地區主要的海洋展示與教育場館。建物佔地約2.5公頃，館舍空間約4,600平方公尺，布局包含沿岸生態展示區、珊瑚礁生態區與大洋生態區，透過水槽展示、標本與解說設施介紹澎湖周邊海域的生物與海洋環境。建築採局部地中海式白牆拱門搭配綠色屋瓦，入口前設有廣場與停車空間，為白沙鄉重要的觀光據點之一。
澎湖水族館前身為水產試驗所澎湖海洋生物研究中心附設水族展示館，於1998年正式啟用，目的為推廣海洋教育並提供研究單位進行繁養殖與保育展示。館舍成立時，臺灣各地正積極推動海洋意識與親水環境建設，離島地區的水族館在觀光與教育上具有雙重功能。啟用後多年因營運成本與設施更新需求，逐步面臨改善壓力。2017年起，主管機關推動委外經營模式，並以展區更新與服務提升為目標。經過兩年整修後，於2019年重新開館，新增互動展示、主題展區與教育活動，使場館功能更貼近旅遊與教育需求。
澎湖水族館的發展脈絡反映離島海洋展示場館的典型過程：由研究附屬設施轉型為觀光與教育並重的地方型機構。委外經營與館舍更新的推動，使水族館不再僅以靜態展示為主，而加入活動式主題展、海洋保育課程與體驗活動，顯示國內水族館產業朝向多元營運模式發展。館方與水產試驗所的合作則延續其研究功能，包括繁養殖技術、復育與放流等工作，使其具備展示與保育並行的特性。近年推出的教育主題活動、季節展覽與互動闖關遊戲，呈現館舍由「展示空間」向「學習場域」轉型的趨勢。整體而言，澎湖水族館的設立與轉型有助於理解澎湖海洋觀光、研究機構合作、地方治理與教育推廣的交織關係，是白沙鄉公共文化與海洋教育的重要基礎設施。
