中屯開心亭的古井位於廟宇左側、鄰近港口進出道路旁，是早期中屯村民日常取水的重要水源之一。此井原本為露天石砌井體，後經整修改建為現今可見的花崗石井欄，井欄側面刻有「飲水思源」字樣，象徵提醒後人不忘早期生活取水的不易。由於地理位置靠近港口，古井曾長期嘉惠往來漁民、行路者與附近居民，是中屯聚落生活系統的核心基礎設施之一。現今古井的井口已占蓋起來，顯示已不再作為生活用水來源，但井體仍被保留於開心亭外側，作為地方歷史與生活記憶的物質見證。

在自來水普及之前，澎湖聚落多依賴井水、圳溝與雨水儲存系統維持日常需求。中屯居民在聚落形成初期即在港口附近開掘此井，以供漁民補給、清洗器具，並提供周邊居民汲水使用。井的位置毗鄰開心亭，使取水行為與祭拜活動自然連動，形成生活流程中「取水-拜神-返家」節奏。隨著1960年代以後自來水系統逐步覆蓋白沙鄉，古井原有的功能逐漸減弱。目前井口雖被封蓋，但似乎仍有偶而使用，且井身完整顯示有列入廟宇整建工程中。井欄上雕刻的「飲水思源」語彙，為整修時加刻的內容，目的在於保留舊有水源文化，提醒後人珍惜現代便利水資源。

中屯開心亭古井的現況呈現出聚落生活方式從依賴傳統水源轉向自來水系統後的變遷痕跡。井欄上所加刻的「飲水思源」語句，使古井在制度性使用功能消退後，轉為承載地方歷史與生活經驗的標誌物，也反映出在地居民希望後代理解早年取水不易與淡水珍貴性的意圖。古井位處港口進出要道，一度兼具便利、共享與庇護等多重角色，其保存狀態亦間接呈現聚落空間中「生活設施」向「文化地景」轉化的過程。如今古井雖不再肩負居民日常取水需求，但仍以實體形式保留於廟側，成為認識中屯早期生活技術與水源利用方式的重要線索。