吉貝武聖殿自1653年（明永曆七年）創建以來，歷經多次重修與改建。1929年（日治昭和4年）曾整修廟體，日治時期後期因人口增長與信眾增加，原一層四合院式廟宇已不敷使用。至1960年左右，村民發起重建，改建為兩層樓式建築，上層為主殿，下層作為民眾集會與仲裁場所，並正式更名為「武聖殿」。重建資金主要來自島上漁業收益分抽與旅臺鄉親募捐，據廟方記錄，三年間籌得新臺幣三十八萬餘元，其餘不足部分由外地吉貝人樂捐補足。2005年武聖殿完成整修入火安座，現貌煥然一新，仍保持兩層格局。上層主祀文衡聖帝，並列祀關、張、趙、馬、黃五虎將軟身神尊、諸葛武侯、關太子與三千歲中壇元帥等神祇。據傳五虎將神尊為先民由唐山背渡而來的開基神像，至今仍保存良好。

武聖殿的重建歷程反映了吉貝社會的凝聚力與自我治理精神。面對人口增長與島嶼發展，居民以共同出資、勞力參與的方式完成廟體重建，不僅象徵宗教信仰的延續，也展現社區自發組織的成熟。在信仰層面上，文衡聖帝象徵忠義與守信，五虎將與諸葛武侯則代表智慧與勇武的平衡。這組神格結構，映照出海島社會以「忠、義、智、勇」為核心的倫理體系。此外，武聖殿兼具廟宇與集會所功能，見證澎湖宗教空間如何同時承擔行政、教育與社會協調角色，是典型的「廟治村落」模式。

對吉貝居民而言，武聖殿早已成為生活節奏與集體記憶的象徵。每年農曆六月二十四日關聖帝君聖誕，全村總動員舉辦酬醮與遶境活動，家家戶戶懸燈結綵，街巷鼓樂喧天。迎神儀式中，島民會分別迎請「大爺、二爺、趙子龍」神尊回家坐鎮，若同日有多家喜事，更須以擲筊決定迎駕次序。這種熱烈又秩序分明的信仰活動，成為吉貝人共同的文化節奏。