赤科山是海拔八百餘公尺高的臺地，茶區主要分布在海拔800~1000公尺區間。當地原盛產俗稱「赤科仔」的櫸木，屬高山茶區終年有霧氣，四季氣候適中，雨季集中於五月至十月，且雨量充沛適合農業生產。赤科山早期(2011年前)屬林務局法定造林地，僅限種植林木與金針花，無法大規模契作其他經濟作物。於2011年(民國100年)解編，林務局開放部分土地從事農牧業工作，而後陸續改善對外道路交通。

此茶區種茶歷史為1989-1990年(民國78-79年)間開始，初期種植品種為「青心烏龍」，1994-1995年(民國83-84年)引進新品種「臺茶12號－金萱」種植，每年春茶於四月初開始採摘，冬茶至當年12月份採摘完畢。2005年(民國94年)春季，玉溪地區農會以赤科山茶區所產茶葉命名為「赤科山高山茶」進軍茶葉市場，2007年(民國96年)至今全區種植面積約40公頃。

此茶區茶農過去多販售茶菁為主，銷售價值並不高。近年來，玉里鎮公所為輔導產地該區茶農並建立品牌形象，於2016年(民國105年)舉辦第一屆赤科山蜜香紅茶評鑑拓展銷路，以提升整體茶農收益。