本研究應用41組EST-SSR引子分析臺灣12個茶樹主要經濟栽培品種，結果顯示核酸毛細管電泳分析儀，可取代一般高解析度瓊脂膠體，來分離EST-SSR分子標誌；所開發各組EST-SSR引子，可偵測2～12個對偶基因，平均為6.17個對偶基因；而其多型性資訊量（PIC）介於0.19～0.86間，平均為0.64，表示多型性相當豐富。
僅需使用本研究所開發之兩組EST-SSR引子，即可完全鑑定臺灣12個主要經濟栽培品種。
EST-SSR分子標誌不但可成為鑑定臺灣茶樹主要品種的鑑定依據外，還可作為追蹤品種之父母本來源的工具。
