胡智益碩士論文第四部份主題為「利用分子標誌對成茶品種鑑定之可行性探討」，在成茶品種鑑定方面，利用不同發酵程度的茶類探討製茶過程對DNA品質之影響，說明高溫（250℃）殺菁對成茶DNA的破壞力最強。

       利用成茶DNA樣品進行PCR擴增反應，說明位於分子量小於1000 bp的ISSR分子標誌之條帶強度變化不大且較穩定，應可利用成為辨識品種的依據；而利用胞器通用引子觀察所有包種茶的樣品均可得到穩定的專一性條帶，說明專一性條帶除了條帶強度較強、穩定性更高外，分子標誌可出現在較高分子量的位置，可應用於成茶的品種鑑定，又由於茶樹胞器基因體為單倍體，可有效利用於鑑定品種內變異或混合品種之茶葉。