新竹孔廟創建於嘉慶二十二（1817）年，道光四（1824）年完工。當時的新竹市為淡水廳治所在，屬於縣（廳）學的孔廟設置於竹塹城內，顯現清代新竹地區由開墾社會邁向文治社會。日本統治時期引進新式教育，因孔廟在市區所佔的腹地廣大，孔廟遂被挪用為新式教育場所，長期作為文教重心。明治三十一（1898）年10月設立的新竹公學校，最初借用位於西門的明志書院作為校地，明治三十九（1906）年孔廟修繕完成後，新竹公學校的校地遷至此處，直到昭和十二（1937）年才遷移他處。