新竹市東區東門國民小學位處新竹市市政、商辦中心位置，創立於明治三十年（1897年）10月1日，學校地點在明志書院舊址（西門街和西大路交叉口一帶），校名為「新竹國語傳習所附設小學科」，作為日人子弟的教育機構。明治三十五年（1902年）5月1日更名為「新竹尋常高等小學校」，並於大正三年（1914）遷移至東門外（東門國小現址）。光復後，民國39年（1950年）縣治成立，校名改稱「新竹縣新竹市立東門國校」。民國71年（1982年）7月1日新竹市升格為省轄市，校名改稱「新竹市東門國民小學」，並沿用至今。