虱目魚養殖是臺南乃至臺灣早期的養殖魚業濫觴，據學者鄭維中在〈烏魚、土魠、虱目魚：多元脈絡下荷治至清領初期臺灣三種特色海產的確立〉一文的研究，可能是十七世紀明鄭時代自印尼引入，虱目魚養殖傳統上以淺坪式魚塭為主，再加上越冬溝以應變冬季寒流來襲時提升魚群生存率，但是近幾年來深水式養殖加上打水機的組合逐漸普及，使用調配營養的人工飼料也使收穫量大增，為南部的虱目魚加工奠定了基礎。