從「進香爐主制」經過數度改變，而有今日「財團法人鎮瀾宮董監事」組織形態。演變階段大致如下：

（一）西元1974年（民國63年）前：由爐主、頭家主辦進香及割火事宜，正、副爐主各負責供奉一尊進香媽祖，共有兩尊進香媽祖，因此又稱為「正爐媽」、「副爐媽」。日治時代，較少人出來「卜爐主」，因為需要一筆錢做事，當時只有大甲街上開店的人敢出來「卜」，所以卜「進香媽」爐主的範圍，限於現在的大甲四里（朝陽、孔門、大甲、順天）。西元1936年（民國25年）做醮時，需較多的經費，才到四鄉鎮收募「緣金」，後來進香「卜爐主」的範圍才擴大，只要有題「緣金」的人，就有權利登記名字參加「卜頭家爐主」。

西元1974年（民國63年）進香活動的規模雖然不減，但從北港進香返回大甲廟中，委員便將兩尊進香媽祖留在正殿神龕中，交由廟方管理，不再讓爐主請回家裡供奉，至此廢除「進香爐主制」，改由管理委員會辦理一切進香事務。

（二） 西元1974年（民國63年）至西元1977年（民國66年）：改由管理委員會主辦，不收「緣金」，由地方人士及行號捐奉進香油錢及各種衣物用品等，信眾自由登記祝壽牲醴之「豬羊份」。

（三）西元1978年（民國67年）至今：改由財團法人主辦，由全體董監事及職員組成進香工作團體，分組負責各項進香事宜。其組織及工作分配大致如下：總團長、總務組、財務組、祭祀祖、秩序組，各組包括負責人一名、組員數名、司機一、二名。