鯨豚研究學者王愈超（John Wang）西元2015(民國94年)發表於《Zoological Studies》科學期刊的研究指出，位於台灣西海岸的白海豚族群，因為地理區隔的因素，無法與中國沿海水域的白海豚基因交流，在演化上獨立於中國水域的白海豚，屬於亞種。

依傍著台灣西海岸的中華白海豚，如今在科學研究下，確認為台灣特有亞種，並以台灣為名，經由學者發表於國際期刊，從今以後正名為「台灣白海豚」。面臨台灣白海豚全球族群數不破百，民間團體積極要求重視白海豚以及海洋生態保育。

東台灣海峽白海豚國際顧問團陳昭倫博士摘要這份論文的重點時指出，分析在台灣水域與中國水域的海豚斑點圖樣的差異性，得出幾近無重覆分佈的結論，符合亞種界定的「75%原則」－94%的群體能夠從另一個群體的99%以上被辨別出來，再加上地理區隔與動物行為上的不同，都提供了台灣白海豚為亞種的證據。台灣白海豚（S. c. taiwanensis）的正模標本和副模標本的樣本已被建立。

台灣蠻野心足生態協會與台灣媽祖魚保育聯盟即認為，政府應制定積極保育政策，降低棲息地減少、水及空氣汙染、不當漁法傷害、增加河川淡水補注、水下噪音等，台灣白海豚所面臨的五大威脅。舉凡填海造陸與海岸工程都應避免，完成水汙與空汙的總量管制、加強巡邏並嚴懲非法捕撈行為、減少水庫或攔河堰的開發、減少不必要的海域炮擊及打樁等。