水稻長到一定高度後，便要開始除草，通常是在插秧不久之後。穀笠合作社契作的水稻田因為不噴藥、不灑除草劑，所以田中雜草長得特別繁茂，若不清除，看起來數量甚至超過稻米。 水田內的除草方式有數種選擇。手工除草的話，必須站穩腳步，用像打太極的方式在田裡移步，將雜草連根拔起，再塞進土裡作養分，台語稱之為「挲草」。早期農家更會以跪姿來除草，比較省腳力，但膝蓋很容易瘀青。目前市面上也有田內的除草機可運用，機器的齒輪能配合稻株和稻株的株距，用輾壓的方式將雜草壓入土裡。 除草是很消耗耐性的工作，也是農人最不喜歡的工作，因為田裡萬萬不能讓它滋長出雜草，除了會搶稻苗的養分外，收割的時候也會讓機器不好收穫，因此長輩都會特別叮嚀，種田一定要做好雜草管理。